Yüksel Performansla Hesaplama

Alt-Yapı

AMAÇ VE YETENEKLER

  • Hızlı kalite kontrol, hata düzeltme ve genom ölçeğinde DNA ve RNA dizisi veri setlerinin montajı.
  • Denklik motifi ve genom annotasyonu için fonksiyonel genetik elemanların benzerlik-temelli tanımlanması.
  • Toptan atomlu ve kaba taneli simülasyonlarla oligomerlerin çeşitli ortamlarda kendiliğinden montaj prensiplerini anlama.
  • Moleküler dinamik simülasyonları kullanarak proteinlerin çalışma prensiplerini anlama.

ETKİ VE UYGULAMA ALANLARI

  • Popülasyon genetiği çalışmaları için mutasyonların ve polimorfizmlerin genom çapında tanımlanması.
  • Madde ıslahında Moleküler Markörlerin tasarımı ve siliko doğrulaması.
  • Proteinlerde hastalıklı durumlara yol açan nokta mutasyonlarının araştırılması.
  • İlaç tasarımı.
  • Nano parçacıkların nanoskopik dağıtım aracı olarak tasarlanması.

CİHAZ LİSTESİ

  • 1 head node and 16 compute node HPC server
  • Total core number: 320
  • Total Ram: 4 TB
  • Total Disk: 80 TB
  • Total GPU: 12 x Nvidia K20 GPU
  • Network: 56 Gb/s FDR InfiniBand
  • 2 redundant air-condition + Chiller
Sabancı Sunum

Yenilikçi ve öncül araştırmalar ile katma değer yaratan mükemmeliyet merkezi.